Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD247P20963 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms