Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC9A1P19634 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms