Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms