Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms