Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL6A2P12110 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms