Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYNP07948 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYNP07948 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms