Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBX7O95931 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms