Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms