Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC24DO94855 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms