Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ZNFX1-206ENST00000469991 640 ntTSL 36.5□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS33B-207ENST00000557470 529 ntTSL 56.5□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.47□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRMP-220ENST00000557489 1253 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPIL2-209ENST00000485930 149 ntTSL 36.46□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHEK1-208ENST00000526937 562 ntTSL 46.45□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTC7B-207ENST00000555239 591 ntTSL 36.43□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 56.41□□□□□ -1.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TUSC3-206ENST00000507400 727 ntTSL 56.38□□□□□ -1.398e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CPQ-207ENST00000525310 568 ntTSL 26.37□□□□□ -1.398e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DLG2-215ENST00000472545 1377 ntTSL 56.35□□□□□ -1.398e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.398e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.398e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADIPOR2-202ENST00000535774 488 ntTSL 46.33□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD51-209ENST00000533741 425 ntTSL 1 (best)6.31□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFG1L-205ENST00000437715 742 ntTSL 56.31□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BPTF-213ENST00000580465 1951 ntTSL 26.31□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP28-215ENST00000584387 443 ntTSL 56.29□□□□□ -1.48e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.418e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-243ENST00000636541 527 ntTSL 56.24□□□□□ -1.418e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRMP-219ENST00000557472 549 ntTSL 46.22□□□□□ -1.418e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-214ENST00000580039 998 ntTSL 56.22□□□□□ -1.418e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 METTL2B-202ENST00000419443 411 ntTSL 56.2□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZDHHC2-204ENST00000523132 167 ntTSL 56.2□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KPNA1-205ENST00000470904 3060 ntTSL 26.17□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LSM1-202ENST00000520286 776 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.428e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CNOT6L-202ENST00000504804 1925 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-15■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-206ENST00000563542 8864 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HERPUD2-204ENST00000426180 757 ntTSL 56.13□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OFCC1-210ENST00000481704 398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.12□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-208ENST00000591715 1098 ntTSL 1 (best)6.12□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.438e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.448e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFPM2-AS1-205ENST00000520594 634 ntTSL 36.05□□□□□ -1.448e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.448e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-245ENST00000640183 2378 ntTSL 56.04□□□□□ -1.448e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCKAP1L-204ENST00000548221 3559 ntTSL 26□□□□□ -1.458e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MOB1A-205ENST00000495286 741 ntTSL 35.99□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00472-201ENST00000413945 662 ntTSL 35.99□□□□□ -1.458e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-207ENST00000586089 559 ntTSL 55.96□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RTTN-218ENST00000640408 5589 ntTSL 55.94□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CIR1-203ENST00000461454 804 ntTSL 25.94□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-208ENST00000467184 2369 ntTSL 25.93□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LBHD1-208ENST00000528115 261 ntTSL 35.93□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 25.91□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CNOT6L-206ENST00000512485 1890 ntTSL 55.91□□□□□ -1.462e-15■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 35.91□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SF3B3-210ENST00000567654 334 ntTSL 35.91□□□□□ -1.468e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 25.88□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093297.2-203ENST00000505302 468 ntTSL 25.87□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-216ENST00000511212 555 ntTSL 45.86□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.86□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 25.86□□□□□ -1.478e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TNRC6A-216ENST00000569098 587 ntTSL 55.82□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 55.81□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-216ENST00000447616 707 ntTSL 55.81□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-207ENST00000506985 2399 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-207ENST00000591098 531 ntTSL 25.8□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRDMT1-209ENST00000486947 727 ntTSL 45.79□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LVRN-204ENST00000503329 3676 ntTSL 25.78□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TET2-201ENST00000265149 9588 ntTSL 55.78□□□□□ -1.488e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ACAD11-208ENST00000496418 3684 ntTSL 25.77□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WASHC2C-203ENST00000374359 785 ntTSL 45.76□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-220ENST00000480064 919 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RTTN-214ENST00000639128 4547 ntTSL 55.72□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HAUS1-204ENST00000586060 523 ntTSL 35.72□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLG2-205ENST00000580490 510 ntTSL 35.72□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DAB2-212ENST00000511792 551 ntTSL 45.7□□□□□ -1.58e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 45.69□□□□□ -1.58e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC008764.4-203ENST00000593991 548 ntTSL 25.68□□□□□ -1.58e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.58e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-204ENST00000561618 4784 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.518e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-219ENST00000457496 556 ntTSL 45.64□□□□□ -1.518e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFG1L-202ENST00000421954 1741 ntTSL 55.62□□□□□ -1.518e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.58□□□□□ -1.528e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 35.58□□□□□ -1.528e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.528e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.528e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-234ENST00000631026 914 ntTSL 55.52□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC39A8-206ENST00000512337 251 ntTSL 35.48□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IDE-207ENST00000492362 747 ntTSL 25.47□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-210ENST00000429270 539 ntTSL 45.47□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-218ENST00000590082 565 ntTSL 55.47□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBX-213ENST00000449213 843 ntTSL 55.47□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.538e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBCK-212ENST00000506615 593 ntTSL 35.44□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 35.42□□□□□ -1.548e-6■■■■■ 107
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