Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SCN2BO60939 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SCN2BO60939 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN2BO60939 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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