Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCEO43556 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCEO43556 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SGCEO43556 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGCEO43556 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCEO43556 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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