Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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