Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFS4O43181 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms