Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms