Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms