Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00587B1AMM8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms