Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF839A8K0R7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms