Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PALM3A6NDB9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms