Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMPQ9Y244 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms