Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SORCS3Q9UPU3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms