Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCMF1Q9P0J7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms