Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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HOXC10Q9NYD6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC10Q9NYD6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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