Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COMMD8Q9NX08 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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