Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACKR4Q9NPB9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACKR4Q9NPB9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms