Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

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Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF407Q9C0G0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF407Q9C0G0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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