Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM5Q9C035 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM5Q9C035 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms