Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms