Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms