Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms