Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IFT27Q9BW83 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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IFT27Q9BW83 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFT27Q9BW83 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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