Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM79Q9BSE2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms