Protein–RNA interactions for Protein: Q99704

DOK1, Docking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOK1Q99704 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DOK1Q99704 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DOK1Q99704 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DOK1Q99704 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms