Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms