Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SAMD8Q96LT4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SAMD8Q96LT4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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