Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDXPQ96GD0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms