Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM7Q96FZ5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms