Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms