Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTHRC1Q96CG8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms