Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms