Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HGDQ93099 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HGDQ93099 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HGDQ93099 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms