Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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