Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms