Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms