Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms