Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD53Q8N9V6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms