Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms