Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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