Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPAP2Q8IXW5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms