Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC50Q8IVM0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms